Различные нарушения выработки спермы могут снизить мужскую фертильность. Производство спермы может ослабиться, прекратиться, с возрастом могут возникнуть нарушения в подвижности сперматозоидов. Поэтому важно сдать сперму для составления спермограммы уже на ранней стадии диагностики бесплодия. Нарушение выработки спермы может быть врожденным или приобретенным. Воспаления, различные лекарственные вещества, чрезмерное употребление алкоголя, стресс или другие неблагоприятные факторы могут негативно влиять на выработку спермы, и поэтому в диагностике используют различные дополнительные методы исследований.

Причиной мужского бесплодия может являться несвоевременное лечение крипторхизма (неопущения яичка), что связано с тем, что выработка сперматозоидов напрямую зависит от температуры тела (сперматозоиды вырабатываются в достаточном количестве лишь при температуре тела ниже 36,8). Другими причинами снижения качества спермы являются варикозное расширение вен яичка, а также ранее перенесенные половые заболевания, такие как хламидийная инфекция, или наличие антиспермальных антител.

Фертильность начинает снижаться, когда количество спермы уменьшается до 15 миллионов сперматозоидов на миллилитр. У части мужчин сперматозоиды из семенной жидкости исчезают полностью. Мужчинам, у которых концентрация сперматозоидов менее 10 млн./мл, в Финляндии назначают дополнительные обследования: сдается анализ крови, назначается ультразвуковое обследование мошонки, при полном отсутствии сперматозоидов назначается пункция из яичка для последующего уточнения причины бесплодия. В крайне редких случаях причиной нарушений спермы может возникнуть на фоне хромосомных нарушений или делеции Y- хромосомы. В Y-хромосоме есть локусы, отвечающие за выработку сперматозоидов, и отсутствие их (так называемая делеция) ведет к существенному ослаблению или полному прекращению выработки сперматозоидов. В некоторых случаях причина ослабления активности сперматозоидов остается невыясненной.